概念不同。特殊目的公司是指為特定目的而設立的法人實體；境外投資企業是指在中國境外國家或地區註冊經營的企業。
不同類型。特殊目的公司包括有限責任公司和股份有限公司；境外投資企業包括外商投資企業、港澳臺商投資企業、股份制企業、合夥企業和個人獨資企業。