1，行政級別不同:鐵路集團公司是部級單位；國家鐵路局是國務院各部委管理的國家局，行政級別為副部級。
2.轄區不同:鐵路集團公司下轄18鐵路局集團公司，如北京鐵路局、上海鐵路局、武漢鐵路局等。國家鐵路局只是行政機構，沒有下屬單位。