桂林制藥有限責任公司的主體是原桂林制藥廠。桂林制藥廠落實桂林市政府引進境外戰略投資者的部署，於2004年3月改制為桂林制藥股份有限公司。桂林制藥股份有限公司股東為:上海復星高科技集團有限公司，占股20%；上海復星醫藥(集團)有限公司，占股40%；自然人(原桂林制藥廠職工)，占股40%。
桂林醫藥股份有限公司的子公司有:桂林南藥股份有限公司(桂藥持股94.475%)；鳳凰江山科技發展有限公司(桂瑤持股95%)；重慶樂康藥業股份有限公司(桂藥股份51.57%)；桂林奧林藥業有限公司(貴藥持股49%)。
桂林南藥股份有限公司的子公司為澳洲SGM，桂林南藥持股76.56%。