1，主動與申請人協商，盡量達成壹致；
2.協商不成，可以找當地勞動部門聯系溝通，請他們調解協調；
3.如需到勞動仲裁庭，積極配合勞動仲裁部門提交答辯書，參加仲裁聽證；
4.加強公司人事管理，對所有新員工簽訂書面勞動合同，明確雙方權利義務，並向勞動部門備案，嚴格執行勞動相關法律法規。
員工惡意仲裁後如何處理？
企業如果發現員工惡意仲裁，可以先和員工協商。如果協商不成，可以積極收集證據，應訴仲裁，用證據反擊。如果對勞動仲裁不服，部分案件還可以向法院申訴。
綜上所述，壹般會先進行溝通，溝通不成直接開庭。員工提出勞動仲裁，勞動部門首先會打電話給單位負責人了解情況，順便會咨詢單位的處理方式。如果單位認為自己沒有過錯，壹般會選擇直接開庭，收集相關資料，為開庭準備材料。
法律依據:
《中華人民共和國勞動爭議調解仲裁法》第九條
用人單位違反國家規定，拖欠或者未足額支付勞動報酬，或者拖欠工傷醫療費、經濟補償金或者賠償金的，勞動者可以向勞動行政部門投訴，勞動行政部門應當依法處理。