二是商業擔保成為主流。雖然信用擔保制度設計的初衷是提供非盈利性的政策性金融服務，但在發展過程中，金融資源有限，行業起步階段相應的運行和補償機制不健全。為了彌補擔保資金的不足，各級政府開始引入民間資本，後來也有部分外資進入擔保領域。在這種情況下，商業擔保將很快占據主導地位。2002年對擔保機構的調查顯示，我國擔保機構投資總額中，政府投資占70%，民間投資占30%，基本上是“政府為主，民間為輔”。但到2004年底，私人投資的比例已經占到了總量的50%。2012年，全國8590家融資性擔保法人單位中，國有1907家，占比僅為22.2%。
第三，各級政府對信用擔保機構給予了很多支持。在中央出臺的各項政策指導下，各地安排專項資金用於補償融資性擔保公司風險，支持擔保機構穩健經營。經過不斷延伸和擴大，這些優惠政策現已形成從業務補貼、增量業務獎勵、資金投入、虧損補償等方面為擔保機構提供支持的政策體系。