福州國際機場有限公司是廈門國際機場集團有限公司對福州長樂國際機場集團公司進行資產重組後，於2003年4月7日成立，2003年5月20日正式掛牌營業。公司註冊資本為人民幣5億元，為廈門國際機場集團有限公司的全資子公司。
目前公司擁有三個子公司:福州國際機場廣告有限公司(XIAFA)、福州國際機場巴士客運有限公司(XIFB)、福建空港食品有限公司(XIAFC)。
因此，長樂機場不歸廈門或廈航管轄，產權屬於廈門國際機場集團有限公司，日常運營管理間接由廈門國際機場集團負責。廈門國際機場集團有限公司和廈航不是壹個公司，而是兩個具有獨立法人資格的公司。長樂機場建在福州長樂鎮，行政管轄權肯定屬於福州。