2012年，中國科學院紫金山天文臺發表了192篇科學論文，其中76篇發表在中國境外。SCI論文128篇，其中70篇影響因子在3.0以上，被引用論文95篇；申請專利8項，其中發明專利8項，授權專利5項。該站完成的“高能電子宇宙線能譜超越的發現”項目獲得國家自然科學獎二等獎，作為成員單位參與的“嫦娥二號”項目獲得國家科技進步特等獎，還獲得科技進步二等獎3項(其中1排名第壹)，三等獎1。2015年6月天文臺圖書館官網信息顯示，中國科學院紫金山天文臺是《天文學雜誌(季刊)》和英文刊物《中國占星與天體物理學》的主辦單位。
《天文學雜誌》創刊於1953，是由中國天文學會主辦、紫金山天文臺承辦的綜合性學術刊物，刊登我國現代天文學各學科的高水平科研成果。自1989起，本刊被英國科學文摘(SA)系統和蘇聯文摘雜誌收錄。