2006年初，傅雷博士受聘為上海交通大學藥學院教授，擔任藥物化學研究組組長。研究組的科研涉及化學新藥的設計與合成及其抗腫瘤、糖尿病、心血管疾病、病毒的臨床前研究；藥物劑型的研究；化學藥物靶向給藥和新型治療方法的研發；探索綜合醫學新的系統方法；以及人類休眠可能性和機理。
傅雷教授還發明開發了壹種改善皮膚的中藥配方。並幫助漢高公司成功推出娃娃臉“芙韓方博士”平衡護膚品。
傅雷教授主持了多個R&D項目，並在許多頂級雜誌上發表了文章，如Science、Chemical Review、Frontier of Chemical Research、Journal of American Chemical Society、Angewandte Chemie International Edition of Germany和Journal of Organic Chemistry等。，並持有多項國內外專利。