生物醫學信息工程重點實驗室於2000年經教育部批準，是在原世界銀行貸款建設項目——現代醫學電子技術與儀器國家專業實驗室的基礎上建立的。實驗室依托於Xi交通大學。現任實驗室主任為教授，學術委員會主任為於院士。
實驗室主要研究方向為:(1)醫學信息工程與儀器；(2)生物醫學超聲；(3)心臟電生理和心臟起搏；(4)計算生物信息學及其應用技術。實驗室有固定工作人員34人，其中教授21人，副教授7人。
實驗室現有面積近5000平方米，相對集中。現有設備800多臺，價值4800多萬元，其中大型設備33臺，總價值2605萬元。
自2000年以來，實驗室共完成和承擔科研項目114項，其中國家“973”、“863”重點科技項目8項，國家自然科學基金37項。獲省部級獎勵4項，發明專利9項。在國內外重要學術期刊上發表論文452篇，SCI、EI收錄論文160多篇。實驗室平均每年招收2名博士後，25名博士生，50名碩士生。並接受國內外訪問學者和留學生實驗！