校級科研機構:學習科學研究所、區域(魯南)文化研究所、魯南農村改革發展研究所、資源型城市轉型發展研究所、墨子研究所。
* * *建立研究機構:中興文化研究院、棗莊大學工程技術研發中心、太陽能光伏應用技術研發中心、煤化工技術研究中心、棗莊太陽能新技術應用工程技術研究中心。
院級科研機構:魯南體育文化學院、魯南音樂學院、電視傳播藝術學院、思想政治理論學院、大學英語學院、棗莊方言與文化學院、當代世界與馬克思主義學院、英語語言文學學院、應用數學學院、機電工程學院等。2008年至2012年，學校共承擔國家、省高水平科研項目100余項，其中國家973科研項目2項，國家社科基金2項，國家自然科學基金5項，國家教育規劃項目2項，企事業單位委托的橫向、專項項目70余項。發表學術論文3300余篇，其中SCI、EI、CSSCI收錄320余篇；出版專著和教材100余部；獲得50多項國家專利成果。獲得山東省社會科學優秀成果獎、山東大學優秀科研成果獎等地市級以上科研獎勵120余項。
學校啟動了化學化工研發、機械制造研發等重點項目。承接了棗莊市太陽能電池及光伏供電系統生產線建設項目、化工企業自動化控制及安全鏈改造項目，全面參與臺兒莊古城文化及場館建設。截止2012年底，棗莊學院圖書館共館藏紙質圖書1182000冊，電子圖書1428000冊，紙質期刊2135種，電子期刊9325種，光盤26000余張，各類文獻資源數據庫26個。其中，CNKI中國知網、萬方數據庫收錄學術期刊論文5754萬篇，優秀碩士、博士論文237.3萬篇，全國重要學術會議論文327.3萬篇。文獻收藏涵蓋哲學、社會科學、自然科學、綜合文學等學科。
擁有CNKI中國知網系列數據庫、萬方系列數據庫、國道外語系列數據庫、超星數字圖書館、五車數字圖書館、網上講堂視頻數據庫、學生就業培訓數據庫、考試學習資源庫、多媒體外語學習平臺、讀書節目學術搜索平臺、圖書館建設的棗莊地方文化數據庫、隨書光盤鏡像管理系統等多種電子文獻資源。同時，圖書館網站還為讀者提供多種免費試用資源、OA資源導航、在線工具書、館藏信息查詢、讀者信息查詢、在線咨詢、館際互借、文獻傳遞、圖書在線續借等服務，並享有CALIS重點學科網絡資源、電子閱讀學術搜索、CCC外文期刊網等國內外重要文獻資源。圖書館的OPAC與CALIS中心聯合開放。伊瑞授權的校外接入系統，可支持校園網外各類圖書館文獻資源的IP檢索、瀏覽和下載。圖書館與CALIS中心、國家圖書館、山東大學圖書館、曲阜師範大學圖書館簽訂了館際互借和文獻傳遞協議。