專利權質押合同登記工作由國家知識產權局負責，當事人要辦理質押合同登記的，可以按照以下內容進行辦理：
1、提供主合同和專利權質押合同。當事人雙方應當提供經過協商壹致後，明確合同中專利權質權利關系,專利權是否經過資產評估，如果經過評估，需填寫評估單位名稱，並簽字。如有代理人的，需要代理人簽章。出質人與質權人達成的書面合同後，向專利局辦理登記，專利局申請通過，進行登記後，該合同方能生效。
2、出質人的合法身份證明。出質人或者質權人為企業，應該提交企業的營業執照復印件，自然人應提交本人簽字的身份證復印件。如專利權質押合同中債務人有第三方機構或者個人對專利權行使權利或者責任的，需提交第三方的的相應證明資料。如果在合同行使期間，發生專利權的糾紛，帶來直接或者間接損失，質權人有權利向債務人和擔保人或者機構追償。
3、專利權出質前的實施許可權。專利權所有人需提供享有該專利產品的權利證明，並已經繳納年費，且該專利權證明日期在有效期內。如果專利權存在抄襲或者專利權本身存在權屬糾紛的，專利權無效，相應的質押合同將被視為無效，專利局將不會予以登記。
4、專利權辦理登記變更手續。合同行使過程中，如遇到質權人、被擔保的債務合同條及範圍等需要進行調整或者變更的，經過雙方協商對變更內容達成統壹後，需向專利局提交專利權質押登記表，根據表格填寫清楚質押登記號、出質人信息、質權人信息，變更內容前專利合同簽署的詳細內容，變更後需要調整的詳細內容。經過專利局審核批準以後，變更合同方能生效。
5、專利權質押合同延期與註銷手續。經質押雙方當事人經過協商壹致同意延長合同使用期限的，當事人需要在合同有效期內，攜帶《專利權質押合同登記通知書》及其他相關的材料，去專利局申請辦理合同延期手續，經過中國專利局同意後，合同方生效。
法律依據
國家知識產權局公告第461號——關於《專利權質押登記辦法》的公告
第五條，在中國沒有經常居所或者營業所的外國人、外國企業或者外國其他組織辦理專利權質押登記手續的，應當委托依法設立的專利代理機構辦理。
中國單位或者個人辦理專利權質押登記手續的，可以委托依法設立的專利代理機構辦理。
第六條 當事人可以通過郵寄、直接送交等方式辦理專利權質押登記相關手續。
第七條 申請專利權質押登記的，當事人應當向國家知識產權局提交下列文件：
(壹)出質人和質權人***同簽字或者蓋章的專利權質押登記申請表；
(二)專利權質押合同；
(三)雙方當事人的身份證明；
(四)委托代理的，註明委托權限的委托書；
(五)其他需要提供的材料。
專利權經過資產評估的，當事人還應當提交資產評估報告。
除身份證明外，當事人提交的其他各種文件應當使用中文。身份證明是外文的，當事人應當附送中文譯文；未附送的，視為未提交。
對於本條第壹款和第二款規定的文件，當事人可以提交電子掃描件。明外，當事人提交的其他各種文件應當使用中文。身份證明是外文的，當事人應當附送中文譯文；未附送的，視為未提交。
當事人通過互聯網在線辦理專利權質押登記手續的，應當對所提交電子件與紙件原件的壹致性作出承諾，並於事後補交紙件原件。