院所所有臨床學科和生物醫學工程壹級學科均為博、碩學位授權點，設有臨床醫學博士後科研流動站，承擔了博士後、博士、碩士、本科、大專5個層次13個專業的教學任務，年培養各類學員1800余名，年招收進修生500余名，已建成臨床示教、手術轉錄及遠程教學系統和臨床技能訓練中心。《外科學及野戰外科學》為國家精品課程；“創建現代軍事醫學學科體系培養新型軍事醫學人才的研究與實踐”獲國家教學成果壹等獎；為國家住院醫師規範化培訓基地、國家衛生部內鏡診治培訓基地、國家衛生部介入診治培訓基地、國家衛生部腹膜透析培訓基地、軍隊及重慶市臨床藥師規範化培訓基地、中國紅十字基金會鄉村醫生培訓基地...。 院所具有良好的科研條件，為國家藥品臨床研究基地，擁有全軍第壹個國家重點實驗室—創傷、燒傷與復合傷國家重點實驗室，全軍“重中之重”建設實驗室—戰創傷基礎研究實驗室和全軍重點實驗室—交通醫學實驗室。高血壓病實驗室、創傷基礎實驗室、交通醫學實驗室、車輛生物安全碰撞實驗室為重慶市重點實驗室。承擔了以國家“973”、“863”、國家自然科學基金重點級為代表的重大科研課題，課題總數660余項。先後獲得軍隊、省部級二等獎以上獎勵150余項 ，其中國家科技進步壹等獎1項，國家自然科學二等獎1項，國家科技進步二等獎7項，軍隊、省部級壹等獎24項，軍隊、省部級二等獎118項。近五年發表SCI、EI期刊高質量論文650余篇；5分以上SCI論文60余篇；入選F1000的高質量論文7篇。2014年發表SCI論文202篇，5分以上20篇、10分以上3篇。成功在《Cell》、《nature》、《Science》三大頂尖雜誌發表論著。“十二五”獲得國家專利400多件，2014年實現科技成果轉化1000萬元。每年舉辦大型國際學術會議4～5次，每年接待外國專家來訪100余人次，每年100人次專家教授受邀出國交流 。