皖西學院設有材料與化工學院、機械與電子工程學院、建築與土木工程學院、經濟與管理學院、生物與制藥工程學院、體育學院、外國語學院、文化與傳媒學院、信息工程學院、藝術學院、應用數學學院、政法學院、資源環境與旅遊管理學院、應用科技學院等14個院，46個
該校重視科學研究與實踐應用，堅持以應用型研究為科研方向，註重產學研合作，以科研促教學，以科研強教學。2005年來，在國家核心期刊發表論文616篇，被SCI、EI收錄79篇，ISTP收錄12篇，出版專著18部，編寫教材16部，學術成果獲省部級以上獎勵13項，廳級獎勵35項，獲得國家專利18項，其中國家發明專利4項。獲得廳級以上各類科研項目224項，其中國家級項目8項，國家自然科學基金項目3項，國家社科基金項目4項，省部級項目37項，橫向項目128項，科研經費投入近1200萬元。學校面向國內外公開發行的《皖西學院學報》被評為安徽省高等學校優秀期刊。近三年
來，該校學生在全國、安徽省各類比賽以及研究生入學考試中，均取得了驕人的成績。 2006年12月，該校通過了教育部本科教學工作水平評估，先進的教育思想和辦學理念，以及學校的各項教學工作得到了教育部專家組的高度評價。
該校積極開展對外交流，先後與英國、法國、芬蘭、新加坡、韓國、香港等國家和地區的高等院校、科研院所建立協作和文化交流關系，與芬蘭塞文尼亞應用科技大學聯合辦學。
壹腔熱忱育桃李，萬點星輝映神州，朝氣蓬勃的皖西學院人在黨的十七大精神指引下，高舉鄧小平理論和“三個代表”重要思想偉大旗幟，深入貫徹落實科學發展觀，沿著學校“十壹五”發展規劃繪就的藍圖銳意進取，開拓創新，為把學校建設成為以文理為基礎、應用型學科專業建設為重點、文理工管教經法農多學科協調發展、人才培養質量高、科學研究有特色、服務地方有成效、有壹定綜合實力的應用型本科院校而努力奮鬥。