通州客運站有46條長途直達航線，可直達京津、Xi、青島、泰順、上海等省市以及南京等省內城市。金沙至南通有1品牌線，金沙至三余、農場、平潮有3條品牌線。站內運營公交車156輛，其中中高檔豪華公交車15輛，空調客運公交車87輛，基本形成了大中小學校和高中階段公交車齊全的運能新格局。車站日班425班，月客運運營收入約1.2萬元。新增3條公交線路，公交車輛達到25輛。2003年3月，1路線無人售票。市區新建17信息亭和18公交站牌，公交設施更加完善。貨運方面，北站已建成通州最大的貨運停車場，貨運配載業務得到拓展。建立了疊石、樂進、江藻、小海、川港，形成了貨運配載網絡。修理廠更新了車間、烤漆房，購置了各種機器設備，滿足了修理站內外各種車輛的要求。
通州汽車客運站以三個代表為指導，以經濟建設為中心，以提高服務質量為目標，以豐富創新活動為載體，不斷推進文明創建，兩個文明建設成效顯著。2002年，該站主營業務收入18158500元，副業收入1020萬元，利潤45萬元。從1986年開始，通州汽車客運站先後被評為通州市文明單位，從1997年開始被評為南通市文明單位，1999-2000年度江蘇省文明單位。站黨委被授予南通市先進基層黨組織稱號，其客貨運站再次被授予部級文明站稱號。88車隊被評為省級文明車隊，汽修廠進入南通市汽車修理行業“南通專線”先進單位行列。91、1年2月，主站榮獲省級愛國衛生先進。自1997年以來，連續被授予南通市公共衛生信得過單位稱號，多次榮獲通州市創建的先進集體！