因此，問題中的情況是:
1，彌補土地使用權投入。
借:無形資產3000萬元。
借款:實收資本——“老股東”3000萬元。
2.分期計算土地使用權攤銷額。
月攤銷額= 3000萬元/(企業取得土地使用權投資之日起土地使用權剩余月數)
3.調整實際建賬日前尚未攤銷的土地使用權。
借:長期待攤費用-開辦費
貸款:無形資產
由於涉案企業至今未開始生產經營，土地使用權攤銷應計入開辦費。本分錄金額=月攤銷額*企業取得土地使用權投資之日至實際建賬日前壹個月的總月數。
4.土地使用權應在開戶日的當月及以後月份正常攤銷。
借:長期待攤費用-開辦費
貸款:無形資產
這個分錄的金額是每月攤銷額。
5、開發商品房，結轉無形資產的賬面價值。
借:開發成本
貸款:無形資產
結轉後，無形資產賬面余額為零。土地使用權的賬面價值轉入開發成本後，無需攤銷。
另外，對於標題“雙方實際協商價格為4000萬元”，如果沒有錯誤的話，應該是受讓方(即新股東)支付給轉讓方(即老股東)的股權轉讓款，這筆錢取得的654.38+00萬元收入與企業無關，屬於轉讓方(即老股東)，依法納稅。在會計處理上，該科目中的4000萬元轉賬金額與企業無關，企業只需將實收資本中“老股東”明細賬的余額轉入“新股東”，即:
借:實收資本——“老股東”3000萬元。
貸:實收資本——“新股東”3000萬元。
關於補充問題。
首先，標題中新股東的目的是向老股東購買土地使用權。但需要註意的是，土地使用權並不是老股東直接擁有，而是由企業擁有，由老股東間接擁有。因此，雖然交易雙方是按照土地使用權的市場價格進行交易，但該交易仍屬於企業股權的交易。交易後，新股東不直接擁有土地使用權，也通過其擁有的企業股權間接擁有土地使用權。
因此，問題企業作為會計核算的主體，不會因為股東的變更而發生變化，也就是說，企業是持續性的，其會計核算應該從企業成立之時就開始進行，沒有進行的會計核算應該進行補充。同時，由於題目中的交易金額屬於股權轉讓金額，無論轉讓金額多少，都與企業無關，屬於新老股東之間買賣企業的交易金額。即企業土地使用權原值仍為3000萬元，成交金額為654.38+00萬元(即“升值”)，不能計入企業土地使用權賬面價值。總之，4000萬元的交易金額不應確認為土地使用權轉讓(雖然交易目的相同)，而應確認為企業股權轉讓。
至於題目中提到的“損失”，是不存在的。原因是，雖然上述10萬元的升值並未計入企業賬面價值，但企業市值仍包含10萬元的升值(假設4000萬元的股權交易價格公允)。也就是說，如果新股東繼續轉讓企業股權，仍可收回轉讓款4000萬元。如果新股東不再轉讓企業股權，而是繼續經營，那麽企業的利潤中就包含了未入賬的增值654.38+00萬元，利潤屬於新股東，也就是說新股東享有654.38+00萬元的增值。如果進行利潤分配，新股東實際收回增值654.38+00萬元。所以題目中所說的“損失”是不存在的。
當然，如果企業在產品定價時不考慮10萬元的增值因素，那麽就可能出現新股東的“流失”。例如，如果商品房建設成本(包括賬面土地使用權成本)為10萬元，則商品房價格不得低於110萬元(10萬元)，否則新股東將遭受投資損失。
關於開辦費問題，根據《企業會計準則》(2005年以前)的有關規定，企業應當在開始生產經營之日壹次性轉入“管理費用”科目。企業開始生產經營的日期，可以根據商品房開工建設的日期確定。