基金公司的投資管理部門主要有投資部、研究部和交易部。投資部根據投資決策委員會制定的投資原則和計劃，負責股票選擇和投資組合管理，並向交易部下達投資指令；同時，投資部還負責投資計劃的反饋功能，即時向投資決策委員會提供市場動態信息。研究部是基金投資運作的支持部門，主要從事宏觀經濟分析、行業發展分析和上市公司價值分析。交易部門是基金投資運作的具體執行部門，負責組織、制定和執行交易計劃。
具體程序如下:
1.研究部整合內外部研究力量進行調查研究，向投資決策委員會提供包括宏觀政策、經濟形勢、市場行情等宏觀和微觀信息。
2、投資決策委員會根據研究部門提供的信息制定投資原則、投資方向和總體投資計劃。
3.基金經理根據研究部提供的投資價值分析報告，擬定投資組合和投資計劃，提交投資決策委員會審議通過，再提交風險控制部審核。
4.基金管理人根據投資決策委員會批準的投資計劃向交易部門發出投資指令。
5.交易部將向基金經理和清算人報告投資執行情況。
6.基金經理和清算人將投資總結報告反饋給投資決策委員會。
7、投資決策委員會根據反饋意見，修改投資組合方案。