公元1930年，藥鋪年營業額達到18萬銀元。抗日戰爭前夕，老九芝堂積銀四十萬(含房產)。
1938+065438+10月這壹年，長沙“聞喜”大火，店鋪被毀，資金損失過半。公元1944年，日軍入侵長沙，藥店遷至藍田鎮(今漣源縣)小規模經營。直到抗日戰爭勝利，才回到長沙恢復營業。公元1953年，民族解放的春風給老九芝堂帶來了復興和振興，私營的“新中制藥廠”成立。公元1956年，公私合營，以老九芝堂藥店為中心，合並了幾家藥店，建立了九芝堂加工廠，設計並推出了“芝”的商標。從此，老九芝堂藥店告別了漫長的風雨歷程，進入了壹個全新的時代。1959年更名為“九芝堂制藥廠”。
1967年更名為“長沙中藥廠”。1971年更名為“長沙市第壹中藥廠”。1978年更名為“長沙中藥廠壹廠”。1992年6月在北京人民大會堂召開新聞發布會，恢復“長沙九芝堂制藥廠”名稱。
6月1993，“九芝堂藥店店”在長沙市黃興路黃龍重復營業。1994年6月改制為長沙九芝堂藥業集團公司，實現了工廠制向公司制的轉變。1995年，長沙藥材公司這壹中型國有商業企業被兼並，有效地實現了工商結合、優勢互補的目的。
1996年8月，為加快建立現代企業制度，積極實施集團發展戰略，實現與長沙沈劍醫藥總廠的強強聯合，長沙九芝堂(集團)有限公司正式成立。1999年5月，集團公司與SDIC醫藥投資有限公司(現變更為SDIC創業投資有限公司)、海南祥源經貿公司(現變更為海南祥源工貿有限公司)、湖南省醫藥公司、湖南長沙友誼(集團)有限公司(現變更為湖南友誼阿波羅有限公司)等5家發起人以發起方式設立湖南九芝堂股份有限公司。2000年6月，湖南九芝堂股份有限公司向社會公開發行4000萬股a股，同月在深交所上市，募集資金3.6億元。
2003年7月，湖南九芝堂股份有限公司成功發行51萬股新股，募集資金5億元。2004年，九芝堂全國上市公司深滬排名第二，深市排名第壹。整體實力位居湖南省醫藥行業第壹。6月，湖南九芝堂股份有限公司更名為九芝堂股份有限公司..
2005年，九芝堂完成了工商戰略整合。
2006年5月，九芝堂股份高票通過股權分置改革，促進了九芝堂的持續健康穩定發展。
2008年6月，九芝堂中醫文化被列入中國第二批非物質文化遺產項目，這標誌著以“行醫要盡心，醫者問心”為代表的九芝堂文化已經深入人心，並將得到政府的支持和保護。如今，九芝堂以長沙為總部，分別在瀏陽、成都、海南設立了多家子公司，發展成為總資產6543.8+0.55億元、凈資產6543.8+0.23億元，擁有7家直接控股子公司和3家間接控股子公司，年銷售額6543.8+0.2億元，利稅3億多元的集工商於壹體的現代化大型醫藥企業。未來，九芝堂將繼續以中成藥為核心，努力向生物制藥等領域拓展，發揚300多年的優良制藥傳統，積極采用現代高新技術，努力成為中國醫藥行業10強、中國企業500強之壹，讓壹個全新的九芝堂融入大眾心智。心懷九州精神，憧憬蘭芝美景，緊跟國家發展步伐，緊跟時代潮流，這是九芝堂追求的最高境界，也是九芝堂300年來壹如既往的承諾。如今，歷史將九芝堂帶入了壹個新的時代，這既帶來了機遇，也帶來了挑戰。歷經風雨的九支人，帶著“努力與天氣抗衡”的豪氣，帶著“無論風雨，總比走來走去好”的信心，帶著“無所畏懼，勇往直前”的開拓姿態，從外部抓住機遇，從內部推動改革，繼續腳下的路。