實驗總結
通過TRIzol提取樣品的總RNA,通過逆轉錄獲得cDNA用於下遊實驗。
1.試劑和消耗品
試劑和消耗品
prime Script II 1st strand cDNA合成試劑盒,寶生物工程(大連)有限公司,6210B;;總RNA提取試劑TRIzol,南京中鼎生物科技有限公司,rk 01-100;
DL2000 DNA加標記(100,250,500,750,1000,1500,2000 bp),南京諾沃贊生物科技有限公司,MD101。GelStain,北京全食金生物科技有限公司,GS 101-01;
DEPC,適馬公司,d 5758-25ml;;瓊脂糖,Biowest,西班牙,91622;
離心管,美國Axygen,311-01-051;槍頭,Axygen,美國;
其他試劑在中國都是分析純。
2.主要實驗儀器
主要實驗儀器
超微紫外分光光度計:NanoDrop2000,Thermo公司;臺式高速冷凍離心機,貝克曼公司,Allegra 21R;;
電子天平,AHOMS公司,ar 5120;;紫外線透射儀,Amersham Pharmacia公司,Hofer MV-25;
電泳儀:TY2795,BIO-RAD公司;電泳槽:亞細胞GT細胞,BIO-RAD公司;
凝膠成像分析系統:GelDocXR型號,BIO-RAD公司;雪花制冰機,日本三洋公司,SIM-f 140 ay 65;
移液器,德國Eppendorf。
3.實驗方法和結果
3.1.RNA提取
(1)組織勻漿:向樣品中加入1 ml TRIzol試劑(組織塊的體積不應超過TRIzol體積的10%),用移液管反復吹氣。
(2)將勻漿在室溫下放置5分鐘,直到核酸和蛋白質完全解離。將0.2 ml氯仿加入到1 ml TRIzol試劑用量的均質漿液中,蓋緊試管蓋,手動劇烈搖動15 s,然後在室溫下靜置2 ~ 3 min。
(3)在4℃下10,000克,離心10分鐘。
(4)小心吸取上層水相(無色)並加入新的試管中,同時計算吸取水相的體積。
(5)加入等體積的已預冷的異丙醇,蓋緊管蓋,輕輕搖動。
(6)在室溫下靜置65438±00分鐘,直到RNA完全沈澱。
(7)在4℃下將10,000 g離心10分鐘。
(8)棄去上清液(註意不要棄去沈澱),向每個試管中加入1 ml的75%乙醇,蓋緊試管,輕輕搖動離心管,除去殘留的異丙醇和鹽。在4℃下以7,500離心5分鐘
(9)棄去上清液,打開管蓋,沈澱並幹燥RNA(在室溫下揮發或真空幹燥)。註意,RNA沈澱不能完全幹燥,否則很難溶解。
(10)將RNA沈澱溶解在適量不含RNA酶的水中。
3.2.RNA瓊脂糖凝膠電泳分析
提取的RNA進行瓊脂糖凝膠電泳,電泳圖譜如下:
3.3.RNA濃度和純度測試
3.4.RNA逆轉錄成cDNA
3.4.1.基因組DNA去除
使用來自中鼎公司的DNase I,在不含RNase的離心管中制備以下混合溶液:
3.4.2.逆轉錄反應
在PCR試管中準備以下反應混合物:
在65℃下反應5 min,然後在冰浴中冷卻。
在第壹步的反應管中制備如下逆轉錄反應溶液:
逆轉錄反應的條件為:30℃ 10分鐘,42℃ 30分鐘,95℃ 5分鐘。冰浴冷卻。該產品儲存在-20℃的冰箱中。
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