1884年，化學家卡爾·杜伊斯堡開始在拜耳公司工作。在他的領導下，拜耳化學家成功地做出了突破性的發明。1888年，拜耳成立制藥部。1891，公司在勒沃庫森購買土地建設生產基地。65438-0897拜耳公司科研人員Felix Gaufman博士成功合成了純化學且穩定的乙酰水楊酸。1899年，阿司匹林第壹次註冊了商標，成為風靡全球的止痛藥。1912，公司將總部遷至勒沃庫森。
1925年，弗裏德裏希·拜耳顏料廠公司與其他公司合並，成立顏料工業集團。勒沃庫森成為該工業集團下萊茵河地區合資企業的主要生產中心。二戰後，盟軍查封了顏料工業有限公司的工業集團，後來又將該企業拆除。1951年，重新組建拜耳顏料廠有限公司。1972年，公司更名為拜耳股份公司，並迅速發展成為壹家國際化工和制藥集團。1973，布朗克斯的bootle生產基地破土動工。蒙海姆作物保護中心奠基儀式在1979舉行。1986，拜耳從美國制藥公司斯特林制藥公司回購拜耳商標在美國的使用權。從65438到0988，醫學研究中心在美國康涅狄格州韋斯特波特落成。
同年，拜耳成為第壹家在東京股票市場上市的德國工業公司。也是在這壹年，拜耳在美國的所有活動都由位於美國賓夕法尼亞州匹茲堡的拜耳美國管理控股公司管理。1989期間，拜耳收購了美國紐約塔雷市的庫柏特斯尼康公司，從而成為全球最大的診斷系統和臨床化學試劑供應商之壹。1990年，拜耳公司以17億馬克的價格收購了加拿大阿爾伯塔省諾華公司的橡膠部門，並更名為Boresa橡膠公司，總部位於加拿大安大略省多倫多市。此次收購使拜耳成為全球橡膠領域最大的原材料生產商。1991年，拜耳展示交流中心在勒沃庫森建成開放。1992年，拜耳將莫比公司、邁勒斯公司、愛克發公司與拜耳美國管理控股公司合並，成立新的運營公司，命名為邁勒斯公司。
2014年2月27日，拜耳集團宣布收購雲南滇紅制藥集團全部股份。