1958 5月，建設部從北京水泥工業設計院抽調17專業人員到華東工業建築設計院成立第四設計室，專門從事水泥廠設計。
1965 12第四設計室從華東工業建築設計院分離出來，成立華東水泥工業設計院，隸屬於建築材料工業部。醫院裏有100多人。
9月1970建材直屬科研設計單位決定下放合並到同壹性質的廠礦，由廠礦領導管理。華東水泥工業設計院搬遷於1972年底結束，150多名職工搬遷至江南水泥廠，稱為江南水泥廠水泥工業設計院，外援設計稱為江蘇水泥工業設計院。後更名為江南水泥工業設計院。
1971 01 01 01 01 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 065438 06438+0 0
65438年6月+0978年8月江南水泥工業設計院更名為國家建築材料工業局第二水泥工業設計研究院。
1980 2月更名為建築材料工業部南京水泥工業設計院。
1982 3月建材工業部決定將湖北黃石華新水泥工業設計院和四川江油四川水泥工業設計院合並為南京水泥工業設計院。1983 3月原南京所、原華信所搬遷至南京鳳凰西街。原四川所因故未遷，後40多名專業技術人員並入南京所。
6月1987更名為國家建築材料工業局南京水泥工業設計研究院。1989年6月，南京院設計大樓竣工開業，位於南京市漢中路209號。
5438年6月至2000年10月與國家建築材料工業局脫鉤，正式進入中國非金屬礦業(集團)總公司，由事業單位改為企業。
200112中材國際工程有限公司由南京院與中國非金屬材料總公司(前身為中國建築材料工業建設總公司)下屬的其他五家單位共同出資組建。南京院是中材國際主要的優質資源、技術支持和品牌背書，是中材國際的母公司。
自此，在中材集團和股份公司的正確領導下，南京院進入了快速發展階段。實施了以總承包業務為核心業務的發展戰略，鞏固了工程設計和核心設備供應市場，促進了總承包業務的快速發展，成功實現了企業向工程公司的轉變。
2008年5月，南京院位於江寧開發區的新R&D中心辦公樓正式竣工並投入使用，建築面積約31，000平方米。
2008年6月5438+2月，中材國際根據中材國際綜發(2008)28號《關於印發中材國際母公司管理整合及邯鄲中材並入母公司決定的通知》，整合母公司生產經營管理體系，將邯鄲中材建設有限公司並入母公司，共同形成了新的中材國際母公司生產經營管理體系。