現有的技術平臺主要有羅氏/454 GS FLX，Illumina/Sol-exa GenomeAnalyzer，Helicos BioSciences的HeliScope？單分子測序儀、極化器；由美國Dana-her Motion公司引進；
以及連接測序，即通過引物定位核酸信息。技術平臺是應用生物系統/固體？系統.
擴展數據:
第二代測序技術的背景；
1，DNA測序技術:
長期以來，DNA測序技術壹直是分子生物學相關研究中最常用的技術手段之壹，在壹定程度上促進了該領域的快速發展。人類基因組計劃、轉錄組分析、微生物基因組重測序、單核苷酸多態性(SNP)分析等方面也促進了其他生物學領域的研究和發展。
每壹代測序技術的更新換代，都標誌著生物學中的基因芯片、數據分析、表面化學、生物工程等領域有了新的突破，並應用於測序領域，大大降低了測序成本，提高了測序效率，使測序朝著高通、低成本、高安全性、商業化的方向發展。
2、第壹代DNA測序:
雖然第壹代DNA測序技術以其1000 bp的測序閱讀長度和99.999%的高準確率幫助人們完成了大量的測序工作，但其測試速度慢、成本高、通量低等缺點也阻礙了它的廣泛應用。
隨著科技的進步和研究人員開發測序技術的努力，2005年羅氏公司發布的454測序系統標誌著整個人類高通的平行測序時代。
第二代DNA測序技術，又稱大規模並行測序(massive parallel sequencing，MPS)和高通量測序(High-Throughput Sequencing)，可以同時對成百上千個樣本中的幾十萬到上百萬個DNA分子進行快速測序，成本低，準確率達到99%以上。
這壹時期的代表技術有羅氏454、Illumina Solexa和ABI固體。因為這個時期的測序技術非常先進，市場主要被這三家公司壟斷。