新城建立後，東平鎮由原來的農場社區管理模式轉變為政府壹體化管理模式，給新城黨委政府帶來了壹系列新的發展課題。如何走出壹條科學可持續的新城發展之路，探索出壹條符合東平鎮發展實際、具有東平發展特色的發展模式？經過調研和思考，鎮黨委、政府在聽取各方意見、綜合各種因素的基礎上，緊緊圍繞崇明縣生態島建設的總體戰略部署，結合農場社區的特點，根據鎮現代農業產業定位對生態環境的要求，並符合居民創造清潔、優美、安全環境的公共需求，確定了生態鎮。在此基礎上，黨委政府提出了“服務、管理、發展”的工作理念。在第壹次會議和第壹屆人民代表大會上確定了生態鎮的建立。在第二次會議和壹屆人代會上，黨委政府制定了東平鎮首輪生態建設三年行動計劃(2009-2011年)，推出了以“壹個目標，五大創造”為載體的城市發展新舉措。
建鎮以來，經過全鎮人民的共同努力，先後榮獲國家衛生鎮、全國社區教育示範街鎮、上海市文明鎮、上海市健康先進社區、上海市平安示範社區、上海市平安街鎮、上海市和諧建設示範街鎮、上海市食品安全示範街鎮、上海市學習型鄉鎮等榮譽稱號。
2017年8月22日，東平鎮被住建部認定為第二批全國特色城鎮。
2020年7月29日，東平鎮在愛國衛生運動委員會被重新確認為國家衛生鄉(縣)。