曾任中國科學院自然資源綜合調查委員會副主任、研究員、博士生導師。現任中國科學院地理科學與資源研究所學術委員會副主任，中國科學院資源與環境科學數據中心學術委員會主任，中國科學院科學數據庫與信息系統工程專家委員會副主任，中國科學院研究生院終身教授。國家減災委員會專家委員會委員、國家科學數據共享工程專家委員會委員。ICSU世界數據中心執行委員會委員兼中國國家協調委員會秘書長。
長期從事信息科學技術在農業、資源、環境領域的應用研究，主持完成多項國家重大項目，解決了壹系列關鍵技術。在15項主要成果中，11項獲得省部級以上獎勵18項，出版專著11部，發表論文80余篇。
20世紀80年代，首次提出了我國資源信息管理體系結構、資源信息分類與編碼、區域開發模型體系和統計空間信息系統模型，為信息科學在資源環境領域的應用做出了開創性貢獻。
20世紀80年代，孫九林先生在河南大學環境與規劃學院(原地理系)擔任兼職教授，為學校培養了許多中青年學者。主要從事地球信息科學和農業信息工程研究。農業、資源與環境信息工程學科帶頭人之壹，國家級有突出貢獻專家。主持完成了多項國家重點工程，解決了壹系列關鍵技術。在15項主要成果中，有11項獲得省部級以上獎勵，其中國家科技進步二等獎4項。20世紀80年代，首次提出了我國資源信息管理體系、分類編碼、區域開發模型體系和統計空間信息系統模型，為信息科學在資源環境中的應用做出了開創性貢獻。20世紀90年代，建成了中國第壹個多品種、大面積的實用遙感估產系統，主持建設了面向應用的中國農業資源信息系統和青藏高原科學數據庫，提出了資源環境虛擬科研環境的初步框架，將信息科學技術在農業和資源環境領域的應用推向了壹個新的階段。
20世紀90年代，建成了中國第壹個多品種大面積實用遙感估產系統，主持建設了面向應用的中國農業資源信息系統和青藏高原科學數據庫。系統闡述了信息農業的理論、方法、技術和工程，提出了資源環境虛擬科研環境的初步框架，將信息科學技術在農業和資源環境領域的應用推向了壹個新的階段。
2001當選中國工程院院士。2003年起負責國家試點項目“中國地球系統科學數據共享網絡建設”。
著名的“土地資源與農業信息”工程研究與應用學術帶頭人，長期從事信息科學、資源與農業科學交叉領域的研究與實踐，取得了許多開創性的理論與應用成果，為“土地資源與農業信息”工程科學的建立和國家建設做出了突出貢獻。
陜西師範大學、河南大學兼職教授。