工程中心下設兩家企業:上海國嘉生化工程技術研究中心有限公司(國嘉公司)和上海國強生化工程設備有限公司(國強公司)。國嘉公司主要從事過程優化的研究，尤其是微生物細胞培養過程的優化和放大，包括抗生素、氨基酸、有機酸等傳統生物技術產品的發酵，基因工程大腸桿菌、畢赤酵母等現代生物技術產品的發酵。而國強公司則以生產生物技術實驗室研究和產業化的關鍵設備為主營業務，生產各類生物反應器。其中，具有自主知識產權的產品——生物反應器FUS-50L(A)，專門用於發酵過程優化和放大研究，受到了廣大生物技術研究機構和企業的歡迎。此外，還生產帶pH檢測和加料的搖床，以滿足生物技術研究的需要。
工程中心自成立以來，長期從事微生物產品生產的工程化研究，尤其是工業規模的發酵過程優化和放大技術研究。工程中心團隊在國際上首次提出了多尺度生化過程和生物過程系統生物學的研究理論，建立了基於細胞代謝和參數相關性分析的宏觀代謝流檢測和控制方法，開發了專門用於生物過程優化和放大研究的設備，並將這些理論和方法應用於十余種產品。曾獲國家科技進步獎3項、省部級科技進步獎多項，承擔了“六五”至“十五”國家重點項目、“863”項目、國家自然科學基金、上海市科技攻關項目等項目，出版專著《發酵過程的多尺度研究與過程優化》，發表學術論文65，438+000余篇，SCI收錄20余篇。
工程中心獲獎情況:新型食品添加劑風味核苷酸二鈉生產關鍵技術優化研究，2004年獲國家科技進步二等獎；新型食品添加劑鳥苷生產優化及發酵工藝的多尺度研究，2003年獲上海市科技進步壹等獎；高比活植酸酶基因的獲得和耐高溫植酸酶的生產獲得2003年上海市科技進步壹等獎。基於參數相關性的發酵過程優化放大技術獲2002年國家科技進步二等獎；基於參數相關性的發酵過程優化放大技術獲上海市科技進步壹等獎2001；青黴素發酵優化技術獲國家科技進步二等獎1997。